CleanPlex ®是一種超可擴(kuò)展且超靈敏的NGS 擴(kuò)增子測(cè)序技術(shù)。它具有高度先進(jìn)的專(zhuān)有多重 PCR 引物設(shè)計(jì)算法、極其均勻的多重 PCR 擴(kuò)增化學(xué)物質(zhì) 和 創(chuàng)新的背景清潔化學(xué)物質(zhì)。它們共同使得 CleanPlex 即用型和定制 NGS 面板能夠突破傳統(tǒng)的基于擴(kuò)增子和基于混合捕獲的目標(biāo)富集技術(shù)的限制。
功能亮點(diǎn)：
超高的擴(kuò)增均勻性和超低的PCR背景噪音（更準(zhǔn)確的變異調(diào)用或更低的測(cè)序成本）
單管 3 小時(shí)工作流程，手動(dòng)操作時(shí)間最少（輕松自動(dòng)化）
兼容困難樣品（降解的FFPE DNA、FFPE RNA、cfDNA、cfRNA）和主要測(cè)序平臺(tái)（Illumina、Ion Torrent、Genapsys、MGI DNBSeq）
高的靈敏度（低至單細(xì)胞水平直接擴(kuò)增*）
出色的面板大小可擴(kuò)展性，單個(gè)多重 PCR 池中的擴(kuò)增子數(shù)可達(dá) 20,000 多個(gè)
檢測(cè)和分析單核苷酸變異（SNV）、小插入和缺失（Indels）、拷貝數(shù)變異（CNV）、基因融合/剪接變異、基因表達(dá)水平、腫瘤突變負(fù)荷（TMB）、微衛(wèi)星不穩(wěn)定性（MSI）、內(nèi)部串聯(lián)復(fù)制（ITD）等
具體來(lái)說(shuō)，擴(kuò)增子測(cè)序技術(shù)提供了一種專(zhuān)注于特定基因或特定感興趣基因組區(qū)域的靶向方法。
全基因組測(cè)序（WGS）及其相應(yīng)的全基因組擴(kuò)增（WGA）方法更適合研究和發(fā)現(xiàn)類(lèi)型的應(yīng)用，而靶向測(cè)序或靶向基因測(cè)序?qū)τ谠S多快速增長(zhǎng)的臨床和工業(yè)應(yīng)用至關(guān)重要，這些應(yīng)用的成本和速度都受到限制。更重要。
基因組學(xué)界面臨的挑戰(zhàn)之一是持續(xù)獲取大量測(cè)序原始數(shù)據(jù)，這些數(shù)據(jù)尚未全成功地翻譯和解釋?zhuān)詭椭诟鼜V泛的范圍內(nèi)推進(jìn)研究、診斷和治療疾病。即使目前測(cè)序成本降低，全基因組測(cè)序方法實(shí)際上也只能用于基礎(chǔ)研究、群體遺傳學(xué)或罕見(jiàn)疾病檢測(cè)等特定場(chǎng)景。有針對(duì)性的或有針對(duì)性的方法將更適合了解疾病進(jìn)展并指導(dǎo)臨床環(huán)境中的治療選擇或在工業(yè)應(yīng)用中大規(guī)模篩查 DNA 樣本。此外，就實(shí)驗(yàn)室操作和用于存儲(chǔ)和處理大量數(shù)據(jù)的生物信息學(xué)基礎(chǔ)設(shè)施而言，對(duì)整個(gè)基因組或外顯子組進(jìn)行測(cè)序可能非常昂貴。因此，靶向測(cè)序?qū)τ诰珳?zhǔn)醫(yī)療和研究的持續(xù)進(jìn)步變得至關(guān)重要。
圖 2. CleanPlex DNA 靶標(biāo)富集和文庫(kù)制備工作流程
圖 3. CleanPlex RNA 靶標(biāo)富集和文庫(kù)制備工作流程
Paragon Genomics 總部位于舊金山灣區(qū)，是一家快速發(fā)展的精準(zhǔn)醫(yī)療公司。我們的靶向測(cè)序技術(shù)CleanPlex® DNA、CleanPlex® RNA、CleanPlex® UMI和OmniFusion™為精準(zhǔn)腫瘤學(xué)、傳染病檢測(cè)、遺傳性疾病檢測(cè)、單細(xì)胞分析、分子育種和許多其他應(yīng)用提供全面的解決方案。
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