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高容量cDNA逆轉(zhuǎn)錄試劑盒和普通逆轉(zhuǎn)錄試劑盒的操作流程有何區(qū)別?

時(shí)間:2025-7-3閱讀:59
高容量 cDNA 逆轉(zhuǎn)錄試劑盒和普通逆轉(zhuǎn)錄試劑盒的核心操作步驟大致相似,都是從樣本準(zhǔn)備、反應(yīng)體系配制到進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng),但在具體細(xì)節(jié)和側(cè)重點(diǎn)上存在明顯區(qū)別。

樣本準(zhǔn)備階段

  • 高容量 cDNA 逆轉(zhuǎn)錄試劑盒:由于其對(duì) RNA 樣本的兼容性較好,能適應(yīng)部分降解或純度不太高的樣本,在樣本準(zhǔn)備時(shí),對(duì) RNA 提取后的純度要求相對(duì)寬松。不過(guò),為保證獲得理想的高產(chǎn)量 cDNA,仍需盡量去除可能影響逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)的雜質(zhì),如多糖、多酚等。在面對(duì)大量樣本時(shí),樣本的批量處理能力較強(qiáng),可高效完成多個(gè)樣本的準(zhǔn)備工作,以滿足后續(xù)大規(guī)模實(shí)驗(yàn)對(duì) cDNA 產(chǎn)量的需求。

  • 普通逆轉(zhuǎn)錄試劑盒:對(duì) RNA 樣本質(zhì)量要求較為苛刻,通常需要高質(zhì)量、高純度且完整性好的 RNA。在 RNA 提取過(guò)程中,需更嚴(yán)格地按照操作規(guī)范進(jìn)行,以確保提取的 RNA 純度達(dá)標(biāo)(A260/A280 比值一般要求在 1.8 - 2.0 之間 )。若樣本存在降解或純度不佳,可能導(dǎo)致逆轉(zhuǎn)錄效率低下甚至失敗,所以往往需要對(duì)提取后的 RNA 進(jìn)行更精細(xì)的質(zhì)量檢測(cè)和純化處理,以保證逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)順利進(jìn)行。

反應(yīng)體系配制階段

  • 高容量 cDNA 逆轉(zhuǎn)錄試劑盒:為實(shí)現(xiàn)高產(chǎn)量 cDNA 合成,反應(yīng)體系的設(shè)計(jì)通常會(huì)考慮加大 RNA 模板的投入量以及各反應(yīng)成分的比例。以 Thermo 的高容量 cDNA 逆轉(zhuǎn)錄試劑盒為例,在 20μl 反應(yīng)體系中,可加入 2μg 總 RNA ,同時(shí)配套的緩沖液、dNTPs、逆轉(zhuǎn)錄酶等試劑的用量也經(jīng)過(guò)優(yōu)化,以支持大量 RNA 的逆轉(zhuǎn)錄。此外,一些高容量 cDNA 逆轉(zhuǎn)錄試劑盒會(huì)將部分試劑進(jìn)行預(yù)混,如整合為 2x RT 緩沖液混合液和 20x 酶混合液(含逆轉(zhuǎn)錄酶和 RNase 抑制劑),減少移液步驟,方便實(shí)驗(yàn)人員快速配制反應(yīng)體系,尤其適用于處理大量樣本的情況。

  • 普通逆轉(zhuǎn)錄試劑盒:反應(yīng)體系相對(duì)靈活,根據(jù)不同的實(shí)驗(yàn)需求和樣本情況,RNA 模板的用量范圍較廣,從幾十納克到幾微克不等。各試劑成分的比例也較為常規(guī),在配制過(guò)程中,需要實(shí)驗(yàn)人員根據(jù)說(shuō)明書精確量取每種試劑,對(duì)操作的準(zhǔn)確性要求較高。而且,普通逆轉(zhuǎn)錄試劑盒的試劑往往較為分散,不像高容量 cDNA 逆轉(zhuǎn)錄試劑盒有較多預(yù)混形式,因此在配制反應(yīng)體系時(shí),移液操作步驟相對(duì)較多,耗時(shí)也可能更長(zhǎng)。

逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)階段

  • 高容量 cDNA 逆轉(zhuǎn)錄試劑盒:標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)時(shí)間一般較長(zhǎng),如 Thermo 的高容量 cDNA 逆轉(zhuǎn)錄試劑盒標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)時(shí)間通常為 120 分鐘 。較長(zhǎng)的反應(yīng)時(shí)間是為了確保在加大 RNA 模板量的情況下,逆轉(zhuǎn)錄酶能夠充分發(fā)揮作用,實(shí)現(xiàn)高效且穩(wěn)定的 cDNA 合成,從而獲得足夠量的 cDNA 產(chǎn)物。在反應(yīng)過(guò)程中,對(duì)反應(yīng)溫度和時(shí)間的控制要求嚴(yán)格,以保證逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)的順利進(jìn)行和產(chǎn)物質(zhì)量。

  • 普通逆轉(zhuǎn)錄試劑盒:反應(yīng)時(shí)間相對(duì)靈活,部分產(chǎn)品可在較短時(shí)間內(nèi)完成逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng),如一些快速逆轉(zhuǎn)錄試劑盒可在 30 - 60 分鐘內(nèi)完成。較短的反應(yīng)時(shí)間適合對(duì)時(shí)間要求較高、樣本量較小的實(shí)驗(yàn),能夠快速獲得 cDNA 產(chǎn)物用于后續(xù)分析。不過(guò),不同品牌和型號(hào)的普通逆轉(zhuǎn)錄試劑盒在反應(yīng)時(shí)間上差異較大,實(shí)驗(yàn)人員需要根據(jù)具體產(chǎn)品的說(shuō)明書來(lái)確定最佳反應(yīng)條件。



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