圓二色光譜主要用于測定蛋白質(zhì)的立體結(jié)構(gòu)，圓二色性對R和L兩種圓偏振光吸收程度不同的現(xiàn)象。這種吸收程度的不同與波長的關(guān)系稱圓二色譜，是一種測定分子不對稱結(jié)構(gòu)的光譜法。在分子生物學(xué)領(lǐng)域中主要用于測定蛋白質(zhì)的立體結(jié)構(gòu)，也可用來測定核酸和多糖的立體結(jié)構(gòu)。

1、研究蛋白質(zhì)立體結(jié)構(gòu)：蛋白質(zhì)的肽鍵在紫外185～240納米處有光吸收，因此它在這一波長范圍內(nèi)有圓二色性。幾種不同的蛋白質(zhì)立體結(jié)構(gòu)所表現(xiàn)的橢圓值波長的變化曲線──圓二色譜是不同的。α-螺旋的譜是雙負峰形的，β-折疊是單負峰形的，無規(guī)卷曲在波長很短的地方出單峰。蛋白質(zhì)的圓二色譜是它們所含各種立體結(jié)構(gòu)組分的圓二色譜的代數(shù)加和曲線。因此用這一波長范圍的圓二色譜可研究蛋白質(zhì)中各種立體結(jié)構(gòu)的含量。
2、核酸中所含糖有不對稱的結(jié)構(gòu)：核酸中所含糖有不對稱的結(jié)構(gòu)，它們所含的雙螺旋結(jié)構(gòu)也是不對稱的。它們在185～300納米范圍內(nèi)也有特征的圓二色譜。這些譜與核酸的立體結(jié)構(gòu)的關(guān)系雖不甚顯著，但也可以用它研究某些立體結(jié)構(gòu)。同時圓二色譜與核酸的堿基配對數(shù)有關(guān)系，因此也可用圓二色譜研究核酸的化學(xué)組成。
3、研究核酸的化學(xué)組成：蛋白質(zhì)含酪氨酸、色氨酸和苯丙氨酸，它們在240～350納米處有光吸收，當(dāng)它們處于分子不對稱環(huán)境中時也表現(xiàn)出圓二色性。這一范圍的圓二色性反映出在蛋白質(zhì)分子中上述氨基酸殘基環(huán)境的性質(zhì)。

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